В основе четвертой версии расширенной файловой системы, также известной как ext4, лежит ext3 с некоторыми дополнительными возможностями. Так, ext4 обеспечивает поддержку файлов большого размера, быструю проверку файловой системы, позволяет более быстро и эффективно выделять дисковое пространство, снимает ограничения с числа подкаталогов в каталогах и включает мощные возможности журналирования. Настоятельно рекомендуется использовать ext4; в любом случае она будет выбрана по умолчанию.

Высокопроизводительная, масштабируемая файловая система XFS изначально была разработана компанией Silicon Graphics, Inc с целью поддержки файловых систем размером до 16 эксабайт (это примерно 16 миллионов терабайт), файлов размером до 8 эксабайт (это примерно 8 миллионов терабайт) и структур каталогов с десятками миллионов записей.

XFS включает возможности журналирования метаданных, что помогает ускорить процесс восстановления поврежденной файловой системы, допускает динамическое изменение размера и дефрагментацию подключенных файловых систем.

Файловые системы в Red Hat Enterprise Linux 6 используют новую возможность освобождения блоков, позволяющую сообщать устройствам хранения о неактивных блоках. В то время как некоторые накопители блокируют эту функцию, более новые твердотельные накопители SSD используют это для оптимизации внутренней структуры данных, а некоторые устройства SCSI используют полученную информацию для динамического выделения LUN.

Сетевая файловая система (NFS, Network File System) обеспечивает подключение файловых систем по сети удаленными компьютерами, тем самым разрешая обращаться к ним аналогично тому, как осуществляется обращение к локальной файловой системе. Это позволяет системным администраторам объединять ресурсы в централизованные серверы. Red Hat Enterprise Linux 6 поддерживает NFSv2, NFSv3, NFSv4. По умолчанию для подключения файловых систем с помощью NFS используется версия 4 (NFSv4).

NFS в составе Red Hat Enterprise Linux 6 теперь включает расширенные возможности поддержки IPv6.